DIVERSIDADE
GENÉTICA EM ESTIRPES DE XANTHOMONAS AXONOPODIS PV. CITRI
ATRAVÉS DE MARCADORES MOLECULARES BASEADOS EM REGIÕES
GENÔMICAS REPETITIVAS
ALVES, K.C.S.¹*,
TAKITA, M.A.¹, SOUZA, A.A.¹, COLETTA-FILHO, H.D.¹**
A bactéria Xanthomonas axonopodis pv citri (Xac) patovar “A” é responsável pela doença em citros conhecida como cancro cítrico. Embora medidas de contenção e eliminação da doença venham sendo adotadas no estado de São Paulo, novos surtos da doença no sistema produtivo, seja ele campo ou estufas, frequentemente são relatadas. Estes surtos podem ser decorrentes de inoculo remanescentes ou novas introduções. Porém, os trabalhos visando estimar a diversidade genética em Xac conduzidos até o momento utilizando-se diferentes marcadores moleculares como RAPD, rep-PCR and SNPs apontaram para uma estreita diversidade genética deste patógeno onde a população é estritamente clonal, principalmente ao nível do Estado de São Paulo. Regiões genômicas repetitivas (SSRs) com potencial para identificar loci VNTR (Variable Number of Tandem Repeats) têm sido identificadas dentro do genoma de procariotos e usadas para o desenvolvimento de marcadores moleculares reprodutíveis, neutros e com alto polimorfismo. No genoma da Xac foram identificadas várias regiões com seqüências repetitivas. O objetivo deste trabalho é avaliar o padrão de amplificação de regiões SSR presente no genoma desta bactéria. Para isto, conjuntos de primers flanqueando estas regiões foram desenhados e estão sendo utilizados na caracterização de estirpes desta bactéria, gerando VNTR loci. DNA de isolados de Xac foram obtidos de diferentes regiões do Brasil, inclusive do Estado de São Paulo. As regiões de SSR foram amplificadas com 10 pares de primers. Deste total, oito conjuntos de primers geraram polimorfismo entre os isolados analisados. Pelo menos 4 haplótipos de Xac foram identificados causando cancro cítrico nas diferentes áreas citrícolas do Brasil. Entre as estirpes oriundas do estado de São Paulo, 3 diferentes haplótipos foram identificados. Portanto, estes marcadores baseados nas regiões repetitivas apresentam potencial para a caracterização de isolados de Xac sendo indicados para estudos de diversidade genética visando inferências sobre a origem da bactéria quando da ocorrência de um novo surto, assim como de estrutura genética de populações deste patógeno. Palavras-chave: microsatélites, marcador molecular, cancro cítrico e Xanthomonas citri.
Classificação
do trabalho na Tabela de Áreas do Conhecimento no CNPq:
|