ESTRESSE
HÍDRICO: INFORMAÇÕES PRELIMINARES A PARTIR DA
ANOTAÇÃO DO GENOMA DO CAFÉ FRANÇA, E.S. de S.¹*;TORRES, G.A.M.¹**;
COLOMBO, C.A.¹***
O Café é importante fonte de renda para a economia brasileira, representando para o agronegócio um ganho de 10 bilhões de reais anuais. A cafeicultura está presente em regiões do país bastante diversas quanto às condições edafo-climáticas. Sabe-se que tanto a produção quanto a qualidade da bebida são variáveis em função de fatores bióticos e abióticos, destacando-se entre estes, a falta de água que é determinante para a manutenção da qualidade do produto. Estudos na área da biotecnologia constituem-se em fortes aliados para a melhor compreensão da fisiologia das plantas e da performance agronômica da cultura. Com este objetivo, teve início em fevereiro de 2002 o Projeto Genoma Café, resultado do seqüenciamento de várias bibliotecas de cDNA. Neste contexto, o presente trabalho consistiu na análise e na anotação de seqüências de cDNA obtidas pelo projeto ‘Genoma do Café’. Foram feitas buscas de similaridade de seqüência a nível nucleotídico e de aminoácidos empregando-se o programa Blast. A partir da identificação da função putativa do gene analisado foram identificados domínios específicos e ordenadas as seqüências mais similares em plantas e demais organismos. Dos 100 contigs anotados, 64 apresentaram as seguintes funções putativas: 36, função enzimática; 11 com função de transporte; 5 estão envolvidos na transcrição; e 12, estão envolvidos em funções variadas como sinalização, metabolismo de carboidratos, ou ainda, processamento e degradação de proteínas. Os trinta e seis restantes codificam para proteínas de função desconhecida. Tendo-se como base a anotação desta centena de contigs, uma análise mais fina foi realizada dando-se enfoque àqueles apresentando função potencial em mecanismos gerais de tolerância ao estresse hídrico. Alguns destes cDNAs de interesse servirão de base para projeto de data mining e serão objeto de estudos de caracterização e análise funcional. Palavras-chave: bioinformática, ESTs-seqüências expressas, café, estresse hídrico.
Classificação do trabalho na
Tabela de Áreas do Conhecimento no CNPq:
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