POLIMORFISMO
DE LOCOS SSR PARA CONSTRUÇÃO DE UM MAPA DE LIGAÇÃO
GENÉTICA ENTRE POPULAÇÕES HÍBRIDAS DE
C. ARABICA X C. CANEPHORA
LIMA, P.F.¹*; MOLLER,
M.²; PRIOLLI, R.H.G.²; RAMOS, L.C.S.¹; GALLO, P.B.²;
MAZZAFERA, P.³; COLOMBO, C.A.¹** O polimorfismo e a segregação de locos SSR, SSR-EST e marcadores AFLP foram analisados em populações segregantes de C.arabica cv Bourbon Vermelho X C.canephora 4n no intuito de ser construído um mapa de ligação. Através da busca de seqüências expressas provenientes do Banco do Genoma Café, foram desenhados e testados 10 pares de SSR-EST, tendo quatro deles apresentado divergência nos genitores e segregação condizente com sua origem nas populações F2 e RC1 (C.arabica X C.canephora 4n) X C.arabica cv Bourbon Vermelho. Dos 15 pares de SSR genômicos analisados 40 alelos foram validados para estudo de mapeamento. Entre as 40 combinações de primers MSEI+3 e ECORI+3 analisadas nestes mesmos parentais, 147 marcas foram polimórficas. Correlações entre os três marcadores (AFLP x SSR; AFLP x SSR-EST; SSR x SSR-EST), realizadas em 10 indivíduos, foram positivas e significativas, qualquer que fosse a combinação, embora quando 126 indivíduos F2 foram utilizados para a mesma análise, a correlação obtida entre SSR e SSR-EST foi baixa. Os resultados provenientes dos locos SSR-EST e locos SSR genômicos propiciaram uma estimativa da introgressão do genoma de C. canephora em C. arabica, observando-se uma freqüência média de 0,40 alelos de C.canephora na população F2 e 0,38 na população RC1. A técnica utilizando marcadores AFLP mostrou-se mais eficiente devido: a) à quantidade de marcadores polimórficos gerados em um único gel, b) à capacidade de detecção do polimorfismo considerando a variação das bases arbitrárias dos primers e, por último, c) à especificidade na amplificação devido ao uso de primers com maior número de nucleotídeos. Palavras-chave: mapeamento genético, SSR, SSR-EST, AFLP, introgressão
Classificação
do trabalho na Tabela de Áreas do Conhecimento no CNPq: |