O Centro de Análise e Pesquisa Tecnológica do Agronegócio da Horticultura (Centro APTA de Horticultura) foi reorganizado pela união das atividades e funcionários das antigas Seções de Floricultura e Plantas Ornamentais, de Hortaliças, de Plantas Aromáticas e Medicinais, de Raízes e Tubérculos e de Plantas Tropicais.
Conforme a Portaria APTA - 242, de 16/05/2002, o Centro APTA Horticultura constitui-se em uma unidade de coordenação da pesquisa e desenvolvimento, de abrangência estadual, com objetivos de gerar e transferir conhecimentos com foco nas demandas das cadeias de produção da horticultura. Tem como atribuição a formulação e gerenciamento de políticas públicas e diretrizes de pesquisa multidisciplinar, visando a interação entre as unidades da APTA, em atuação matricialmente articulada com o Departamento de Descentralização do Desenvolvimento (DDD), o Instituto de Economia Agrícola (IEA), o Instituto Biológico (IB), o Instituto de Tecnologia Agrícola (ITAL) e o Instituto de Zootecnia. Conta, para isso, com um Conselho e um Núcleo de Pesquisa e Desenvolvimento.
O Núcleo de P&D da Horticultura se caracteriza por atuar com uma grande diversidade de produtos, processos e disciplinas. Entre os produtos, incluem-se as hortaliças diversas, flores e plantas ornamentais, plantas aromáticas e medicinais, raízes e tubérculos e palmeiras produtoras de palmito, que têm grande importância econômica e apresentam elevado índice de agregação de valor. Ademais, a geração e difusão de tecnologias dirigidas ao agronegócio hortícola atendem programas estratégicos como Agricultura Familiar, Segurança Alimentar, Competitividade da Agricultura, Regionalização Agro-industrial e Agricultura de Precisão.
Para atender os objetivos institucionais na área da horticultura, o Núcleo de P&D do Centro APTA da Horticultura conta com um corpo técnico de 24 pesquisadores e 15 funcionários de apoio.

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