O IAC possui seu QUARENTENÁRIO, legalmente oficializado pela Defesa Agropecuária, desde 15 de maio de 1998 (D.O.U. nº 91). Atualmente está credenciado a realizar quarentena de plantas, inclusive em regime de contenção com plantas geneticamente modificadas – CTNBio (Certificado de Qualidade e Biossegurança nº 0065/98, D.O.U. nº 170).
A viabilização do chamado Complexo Quarentenário somente foi possível graças ao apoio da FAPESP, CNPq e FINEP, com disponibilização de verbas no valor de R$ 1.500.000,00 aproximadamente. Para realização de suas atividades, conta com o apoio científico das Comissões de Quarentena e de Biossegurança e com estrutura de telado, casa-de-vegetação, laboratório de conservação in vitro, criopreservação e câmaras frias.

À esquerda: Inspeção realizada pelo Cenargen, DFA/DF e DFA/SP, visando o credenciamento do Complexo Quarentenário do IAC.
À direita: Imagem de quarentena de Alface introduzida da Holanda.

A Comissão de Quarentena tem por finalidade executar os trabalhos de inspeção e limpeza fitossanitária de germoplasma introduzido no Complexo Quarentenário “Emílio Bruno Germek”, como apoio aos trabalhos de coordenação executados pelo Jardim Botânico. As áreas e as equipes são as seguintes:
| COORDENAÇÃO | |
| COORDENAÇÃO GERAL | Renato Ferraz de Arruda Veiga |
| COORDENADOR SUBSTITUTO | Christina Dudienas |
| COORD.TÉC./SECRETARIA | Miriam Aparecida Bonatto; |
| CONTATO DFA / AMOSTRAGEM | Antonio Alberto Costa |
| ESPECIALISTAS INSPETORES DAS QUARENTENAS | |
| FUNGOS | Cristina Dudienas |
| FUNGOS | Sérgio Almeida de Moraes |
| PATOLOGIA DE SEMENTES | Margarida Fumiko Ito |
| PATOLOGIA DE SEMENTES | Maria Aparecida de Souza Tanaka |
| BACTÉRIAS | Luís Otávio Saggion Beriam |
| BACTÉRIAS | Christina Dudienas |
| NEMATÓIDES | Carlos Eduardo Rossi (IB) |
| NEMATÓIDES | Wallace Gonçalves |
| VÍRUS | Valdir Atsushi Yuki |
| VÍRUS | Hugo Kuniyuki |
| TESTES ELIZA | José Alberto Caram de Souza Dias |
| PCR | Haiko Enok Sawazaki |
| PCR | Valdenice Moreira Novelli |
| INSETOS | André Luiz Lourenção |
| INSETOS | Edson Possidônio Teixeira |
| PLANTAS DANINHAS | Robert Deuber |
| PLANTAS DANINHAS | Maria do Carmo de S. Soares Novo |
| CULTURA IN VITRO | Luiz Carlos da Silva Ramos |
| CULTURA IN VITRO | Antonio Fernando Caetano Tombolatto |
Identificação de espécies de plantas para a comunidade, bem como intercâmbio de exsicatas de herbário (coleção de espécimes vegetais desidratados e prensados, acondicionados em armários de aço e organizados de acordo com sistema moderno de classificação botânica) são tarefas de prestação de serviço rotineiro e de fluxo contínuo da Instituição, fundamentais para pesquisa e treinamento em diversidade de plantas. Nosso herbário possui mais de 40.000 exsicatas e está catalogado oficialmente como IAC, sigla que o diferencia do herbário micológico que é IACM, dentre os 115 herbários existentes no país.
Como prestação de serviços do herbário pode-se citar o empréstimo de espécimes para consultas, a doação, a permuta, o recebimento de material para identificação botânica, e a permissão de consultas às exsicatas do herbário para trabalhos científicos por estudantes de nível superior e por profissionais

A introdução de plantas é uma prestação de serviços rotineira na Instituição, visando principalmente o suprimento de matéria prima para os trabalhos de melhoramento genético da Instituição e de conveniados. Está sujeita a uma série de riscos, necessitando assim do apoio da equipe de quarentena. O IAC conta atualmente com a introdução oficial de 81.289 acessos. O serviço é realizado através de busca nacional e internacional de germoplasma com características desejáveis ao solicitante, contatos com os detentores do material, contatos com a Defesa Sanitária Vegetal de São Paulo e DF, preparo de documentação exigida para a importação, contatos com despachantes para a liberação alfandegária, manutenção de banco de dados e fichários, e elaboração de livro de introdução com dados de passaporte e registro seqüencial de acessos.
Remessa de germoplasma é outra prestação de serviços efetuada para a Instituição, quer seja por intermédio de doações ou venda, onde se realiza os serviços de preparo de documentação, contatos com a Defesa Sanitária Vegetal de São Paulo ou posto de serviço de Viracopos, confecção do pacote e inspeção do material a ser remetido. Tal serviço conta com uma média de 150 remessas/ano de volumes contendo cultivares, coleções de linhagens, ou até mesmo de espécies, contribuindo com todos estados e 35 países.
A conservação de germoplasma é vista mundialmente como uma das áreas de segurança nacional, aquela que suprirá as pesquisas de novos cultivares viabilizando a alimentação de sua população e, que servirá como moeda de negociação com os países do mercosul e até mesmo a nível mundial. Com a criação do Centro Nacional de Pesquisa em Recursos Genéticos e Biotecnologia (EMBRAPA/CENARGEN), em 1974, foi possível iniciar uma Rede Nacional de Conservação em Recursos Genéticos, da qual também faz parte o IAC.
A prestação de serviços nesta área, uma demanda muito grande para a própria instituição, para universidades e instituições congêneres, integração plenamente viável em curto prazo, somente poderá ser executada, quando todas necessidades mínimas da estrutura, equipamento e pessoal, forem atendidas para a manutenção de germoplasma a médio e longos prazos. Tendo em vista os estudos realizados para a reforma institucional, detectou-se como demanda não atendida, para o Estado de São Paulo, a área de conservação de germoplasma. Assim sendo, o IAC priorizou a elaboração de um projeto que permitiu o início destas atividades na instituição, o qual foi aprovado pela FAPESP, com um total de R$ 182.090,00, concluído em março de 1999, onde realizou-se a reforma dos edifícios de conservação de germoplasma "ex situ" para germoplasma nativo ou exótico abrigando-os em câmaras frias, "in vitro" e em telados. Também foi proposto, em novembro de 2000, o projeto Temático FINEP "Recursos Genéticos no Estado de São Paulo: coleta, intercâmbio, caracterização, avaliação e informatização. Com R$ 500.000,00 deste projeto pudemos equipar os edifícios construídos, agora com câmaras frias a 5 e -10 ºC, com laboratórios de conservação "in vitro" totalmente equipado casa-de-vegetação e telado, além de termos auxiliado com equipamentos e material de consumo muitos BAGs do IAC. Otras câmaras frias advém do projeto Embrapa-OEPAS, duplicando as dependências e servindo aos demais BAGs do IAC com mais R$450.000,00, em 2008.
O Diretor Geral do IAC, tendo em vista a Portaria DG 23, de 08-06-99, que criou o Sistema de Curadoria de Coleções, resolve designar os membros da Comissão de Coordenação e os seguintes membros Curadores de Coleções:
Renato Ferraz de Arruda Veiga (Presidente);Carlos Augusto Colombo; Luiz Antonio Ferraz Matthes; Pedro L. G. Abramides; Rose Mary Pio; Sérgio Augusto Moraes Carbonell; Wilson Barbosa
Executa o trabalho de acompanhamento e auxílio, aos demais Centros, através dos seus Bancos Ativos de Germoplasma e coleções afins (Herbário Plantas vasculares (IAC), Herbário Micológico (IAC M), Coleção de Micorrizas e afins, e Coleção de Insetos), orientando-os e apoiando-os na conservação, identificação e uso dos acessos, inclusive com a manutenção de um banco de dados institucional com o programa PFS, e agora com um projeto da intranet para interligar os BAGs.
Criou-se a figura do Curador de Banco de Germoplasma e a Comissão de Coordenação das Curadorias de Bancos de Germoplasma Vegetal que organizarão seus bancos de germoplasma através de projetos conjuntos, e criou-se, também, o a Comissão de Gestão de Recursos Genéticos do IAC que elaborará as normas para a conservação e uso dos recursos genéticos da instituição (DOE 109, 11/06/1999).
Realiza a Educação Ambiental Agrícola com escolas e púbico visitante na Fazenda Santa Elisa ou nos jardins da Sede do IAC. Aplica o projeto internacional “O Jardim Botânico vai à Escola”, dentre outros projetos ligados a área.

Sede do Instituto Agronômico
Av. Barão de Itapura, 1481
Caixa Postal 28 - CEP 13012-970
Campinas / SP
Tel. (19) 2137.0600