Os 112 anos de fundação do IAC foram comemorados no dia 28 de junho de 1999, com diversas atividades. No período da manhã, a abertura contou com a apresentação do Coral IAC. Seguiram-se pronunciamentos do Diretor-Geral, Dr. Eduardo Antonio Bulisani e do Senhor Secretário de Agricultura e Abastecimento, Dr. João Carlos de Souza Meirelles, homenagens a funcionários aposentados no ano, apresentação do Mapa de Solos do Estado de São Paulo, culminando com a inauguração do Espaço de ex-Servidores. No período da tarde houve uma mesa-redonda sobre Plantas Transgênicas, com a presença do Prof. Dr. Márcio de Castro Silva Filho (ESALQ/USP), Prof. Dr. Ernesto Paterniani (CTNBIO), Dr. Luiz Antonio Abramides do Val (Monsanto) e Miriam Cintra (representante do deputado estadual José Zico Prado). 

         O IAC recebeu, em 17 de novembro de 1999, os primeiros Certificados de Proteção de Cultivares, emitidos para as variedades de cana-de-açúcar IAC 86-2210 e IAC 87-3396. O objetivo da proteção foi o de assegurar direitos sobre as variedades, como comercialização e pesquisa. As variedades são resultado de doze anos de pesquisa. A IAC 86-2210 é uma variedade super-precoce, enquanto que a IAC 87-3396 caracteriza-se pela alta produtividade, bom teor de sacarose e ótima adaptação a solos de menor fertilidade e disponibilidade de água. 
 

          O pesquisador Dirceu de Matos Júnior, do Centro de Citricultura, do IAC, recebeu prêmio de "reconhecimento presidencial", dedicado a alunos que desenvolveram atividades que elevaram o nome da Universidade da Flórida e que se destacaram no desempenho acadêmico. O prêmio foi entregue pelo presidente da Universidade, Dr. John Lombardi, em 15 de abril de 1999. 
 

        O pesquisador Dr. João Paulo Feijão Teixeira, do Centro de Genética, Biologia Molecular e Fitoquímica, do IAC, recebeu homenagem do Instituto de Pesca, da Secretaria de Agricultura e Abastecimento do Estado de São Paulo, em reconhecimento ao trabalho realizado como Coordenador da Pesquisa Agropecuária do Estado e pela contribuição efetiva para o desenvolvimento do Instituto de Pesca. A homenagem aconteceu durante a 8^a Reunião Anual do Instituto de Pesca, em 22 de abril de 1999. 
 

         O pesquisador aposentado do IAC, Dr. Ângelo Paes de Camargo, recebeu, em maio de 1999, o título de "Servidor Emérito do Estado", concedido pelo Governador em Exercício do Estado de São Paulo, Dr. Geraldo Alckmin Filho, pelo zelo e dedicação demonstrados no exercício de suas funções públicas, por mais de 60 anos, tanto no IAC, como no Instituto Brasileiro do Café. 
 

          O ex-pesquisador do IAC, Dr. Bernardo van Raij, recebeu o "Prêmio Internacional de Fertilizantes de 1999", concedido pela Associação Internacional da Indústria de Fertilizantes (IFA). O prêmio é oferecido todos os anos para pesquisas que tenham levado a um avanço significativo no uso de fertilizantes minerais e que tenham sido comunicadas com sucesso aos agricultores na forma de recomendações práticas. Embora individual, o prêmio é o resultado de pesquisas e desenvolvimento em análises de solo e recomendações de adubação e calagem realizadas em equipe, durante anos, no IAC. As pesquisas tiveram, ainda, a colaboração de outras organizações e apoio financeiro do CNPq, EMBRAPA, FAPESP, FINEP, Fundação Banco do Brasil e Petrofértil. O pesquisador recebeu o prêmio durante a Conferência Anual da IFA, realizada de 17 a 20 de maio em Manila, Filipinas. 
 

        O pesquisador Dr. José Alberto Caram de Souza Dias, do Centro de Fitossanidade, recebeu o "Troféu Fumagalli 1999", na categoria Ciência e Tecnologia, em reconhecimento ao desempenho profissional e trabalhos de pesquisa desenvolvidos no IAC. O troféu é uma homenagem tradicional e oficial da cidade de Limeira, prestada pela Aldeia Movimento Pró-Cultura, com o apoio da Secretaria de Cultura, Turismo e Eventos e foi entregue em 29 de maio de 1999. 
 

         O pesquisador Dr. Hipólito Antônio Assunção Mascarenhas, do Centro de Plantas Graníferas, do IAC, foi homenageado durante o II Encontro Regional sobre a Cultura da Soja, realizado em Assis, em 14 de julho de 1999, pela contribuição fundamental na implantação e desenvolvimento da soja na região do Vale do Paranapanema. 
 

        O pesquisador Dr. Altino Aldo Ortolani, do Centro de Ecofisiologia e Biofísica, do IAC, recebeu a "Láurea Sérgio Westphalen", da Sociedade Brasileira de Agrometeorologia. O prêmio foi entregue em 19 de julho de 1999, durante o XI Congresso Brasileiro de Agrometeorologia e a II Reunião Latino-Americana de Agrometeorologia, realizados em Florianópolis-SC. 
 

         A Sociedade Brasileira para o Progresso da Ciência (SBPC) foi fundada no ano de 1948. Poucas pessoas sabem disso, mas a primeira reunião da Sociedade foi realizada em Campinas, iniciando-se em 11 de outubro de 1949, com a maioria das reuniões ocorrendo nas dependências do Instituto Agronômico. 
        Grandes nomes da Ciência brasileira estavam presentes ao encontro: Carlos Chagas, Henrique da Rocha Lima, que era diretor do Instituto Biológico e muitos outros. Mário Ferri apresentou a palestra, "Síntese, natureza química, ativação e inativação de fitohormônios" e João Quintiliano de Avellar Marques, pesquisador do IAC, apresentou a palestra "Conservação do Solo". A Seção de Conservação do Solo do IAC, naquela época já com seis anos de sua fundação, já devia ter muito a comunicar aos outros pesquisadores brasileiros. 
        A SBPC haveria de extrapolar os limites meramente científicos de sua atuação na época do regime militar no Brasil, quando foi um dos redutos do livre pensamento da Ciência. Polêmica, aliás, não parece ter sido um problema da SBPC. Já nessa primeira reunião uma conferência despertou interesse com mais ênfase: foi apresentada por Breno Daniel Silberschmidt e intitulava-se "Vantagens e perigos da unificação de todas as ciências". Devia ser um tema em voga na época, talvez estimulado pela proposição de Einstein de poder resumir toda a Física em uma única equação. Nenhuma das propostas foi aplicada. A Ciência diversificou-se muito, desde então, mas a SBPC soube atualizar-se e manter-se como um ponto de encontro de todos os cientistas brasileiros, de todas as especialidades. O IAC orgulha-se de ter participado de forma tão decisiva, cedendo sua casa, para o nascimento de um foro livre de discussão da Ciência, enfim, de ter feito a sua parte.